Människor ska rapportera ballonglandningar till polisen eller militären och inte röra föremål som har fallit till marken.
Nordkorea skickade upp fler ballonger med sopor mot sydkoreanskt territorium på torsdagen.
Enligt AP sade tjänstemän från Sydkoreas försvarsmakts Joint Chiefs of Staff på torsdagen att Nordkorea skickade ut cirka 420 ballonger från onsdag kväll till tidigt på torsdag morgon.
Pappers- eller plastflaskor
Ett 20-tal av dessa har redan upptäckts i Seoul och den närliggande Gyeonggi-provinsen. De ballonger som har landat under tiden har tagit med sig avfall som papper eller plastflaskor, men de innehöll inga farliga ämnen.
Militära tjänstemän uppmanade ändå invånarna i de drabbade områdena i Sydkorea att rapportera ballonglandningarna till polis eller militär och att inte röra de nedfallna föremålen på marken.
Seoul City Hall skickade också ut varnande textmeddelanden på onsdagskvällen och uppmanade människor att stanna inomhus och se upp för föremål som faller från himlen.
Tusentals skräpballonger redan
Sedan i maj har Nordkorea släppt upp tusentals ballonger med skräp: papper, tygrester, cigarettfimpar och till och med gödsel, i riktning mot Sydkorea. Nordkorea har beskrivit sina åtgärder som en vedergällning mot sydkoreanska civila aktivister som har släppt propagandablad mot Nordkorea över gränsen.
Som AP påminde om är Nordkorea extremt känsligt för all kritik utifrån mot landets auktoritära ledarskap och dess tredje generationens härskare, Kim Jong-un.
Ballongerna har bidragit till en upptrappning av den psykologiska krigföringen mellan de antagonistiska koreanska staterna, vilket har ökat den allmänna spänningen på den koreanska halvön. Seoul svarade på den nordkoreanska ballongoperationen med att sända propaganda eller K-pop-låtar från högtalare nära gränsen till Nordkorea.
